Напомним, что сюжет второй части возвращает вас в подводный город Восторг, но спустя десять лет. Восторг уже не тот, что был раньше – купол, защищающий город от воды, поврежден, часть города затоплена. Однако учитывая возможности главного героя – это не проблема. Играть предстоит исключительно за прародителя Большого Папочки - Дельту (Subject Delta). Облаченный в водолазный костюм, наделенный волей и разумом, имеющий возможность применять и оружие, и плазмиды, он самый грозный и могучий обитатель города. Не всякий противник может противостоять ему, но учитывая, что после десяти лет бесконтрольного развития мутанты стали сильнее и злее, то и Большому Папочке не стоит давать им фору при встрече. Распутывая клубок загадок утопического Восторга, игрок столкнется с выбором – убивать Сестричек или вызволять их, отпуская на свободу. Это и многое другое, включая мультиплеер, игроков ждет в продолжении BioShock.